Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smarca2Q6DIC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smarca2Q6DIC0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms