Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp7Q6A4J8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp7Q6A4J8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp7Q6A4J8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp7Q6A4J8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp7Q6A4J8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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