Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna3Q65CL1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms