Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms