Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms