Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vil1Q62468 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vil1Q62468 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms