Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcncQ62447 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CcncQ62447 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms