Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms