Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3gl2Q62420 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3gl2Q62420 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms