Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Epha6Q62413 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epha6Q62413 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms