Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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