Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sema3bQ62177 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sema3bQ62177 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sema3bQ62177 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sema3bQ62177 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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