Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms