Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga6Q61739 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms