Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms