Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MslnQ61468 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms