Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna2Q61301 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms