Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1eQ61290 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms