Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd2Q61285 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms