Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hif1aQ61221 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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