Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nab1Q61122 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms