Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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