Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasa3Q60790 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms