Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd4Q60688 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms