Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ItgaeQ60677 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms