Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms