Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms