Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam71bQ5STT6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms