Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Bod1Q5SQY2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms