Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88aQ5SNZ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms