Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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