Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3558Q5FWC9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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