Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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