Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms