Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3lQ4KL14 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms