Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Fam220aQ3ZN08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam220aQ3ZN08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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