Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk4Q3V129 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms