Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zmat1Q3V0C1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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