Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SvipQ3UZP4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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