Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prdm6Q3UZD5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms