Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnga4Q3UW12 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga4Q3UW12 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms