Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3USZ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3USZ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3USZ8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3USZ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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