Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28047Q3US59 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms