Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TceancQ3US16 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms