Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmem253Q3UNB8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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