Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp19Q3UJD6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp19Q3UJD6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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