Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Parp8Q3UD82 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms