Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trip13Q3UA06 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip13Q3UA06 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms