Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf180Q3U827 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf180Q3U827 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf180Q3U827 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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