Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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